潔凈室技術(shù)需遵循下列三項原則之一：使?jié)崈羰冶３直揉徑块g更高的氣壓；在潔凈區(qū)與較不潔凈區(qū)的分界處應(yīng)保持較高的排風(fēng)風(fēng)速；采用物理隔離的方式隔離不同的區(qū)域。
在確定潔凈區(qū)劃分原則時，首先需要確定保護對象
1） 保護生產(chǎn)過程（產(chǎn)品）不受人員和環(huán)境污染；
2） 保護人員（環(huán)境）不受生產(chǎn)過程污染；
3） 防止生產(chǎn)過程與人員（環(huán)境）相互污染，即要綜合防護，1）和2）兩項同時要采用。
如果要求采用隔離（屏障）工藝，即必須采用物理屏障密閉局部潔凈區(qū)，這樣就需要隔離：
使生產(chǎn)過程與周圍環(huán)境（人員）隔離；
使環(huán)境、人員與生產(chǎn)過程隔離；
潔凈室技術(shù)被廣泛應(yīng)用于保護生產(chǎn)過程（產(chǎn)品），不受人員和環(huán)境污染。為此需遵循下列三項原則之一：
使?jié)崈羰冶３直揉徑块g更高的氣壓；
在潔凈區(qū)與較不潔凈區(qū)的分界處應(yīng)保持較高的排風(fēng)風(fēng)速；
采用物理隔離的方式隔離不同的區(qū)域。
壓差原則就是防止較不潔凈區(qū)的氣流向潔凈區(qū)倒灌（例如通過門縫），即在潔凈室內(nèi)保持恒定的高壓（５～２０Ｐａ）。其氣流組織原則是低速氣流由潔凈室向著鄰近區(qū)域并保持相對高的壓差。受控參數(shù)就是壓差。
排風(fēng)原則就是形成低渦流或近似于單向氣流，風(fēng)速大于０。２米／秒，由較潔凈區(qū)吹向較不潔凈區(qū)，以防止氣流倒灌。
在應(yīng)用此種方式時，應(yīng)考慮到障礙物，熱源和污染物，排風(fēng)格柵位置等的影響。此項原則的特點就是低壓差，相對高的氣流風(fēng)速。運用此項原則的實例就是位于較低潔凈度級別房間內(nèi)的層流潔凈區(qū)（單向氣流區(qū)）。
區(qū)域的物理分隔原則就是建立隔離裝置，對由較低潔凈度的房間產(chǎn)生的污染形成不可逾越的屏障，不致進入較高潔凈度的潔凈室。
如果是具有有害物的生產(chǎn)過程（個別品種的致病微生物，強烈反應(yīng)的化學(xué)制劑），則應(yīng)保證該處的氣壓相對于環(huán)境是負(fù)壓。
應(yīng)予指出，建立負(fù)壓的要求是與潔凈室的工作原理相矛盾的，潔凈室是基于正壓差的。為了解決此項矛盾，便采用了另加的氣閘室，在潔凈室周圍建立第二層密閉外殼（包括吊頂）使氣閘室相對于鄰近房間和有害作業(yè)具有高的正壓。
為此，就可以采用隔離工藝，例如，在接觸有毒制劑時采用具有負(fù)壓得隔離裝置。